笋干难消化，肠胃不好的人吃了容易胀气拉肚子；胃溃疡、胃炎患者吃笋干会刺激胃黏膜；孕妈吃笋干可能影响胎儿发育；小孩消化系统没发育好别吃；低血糖人群吃笋干可能引发头晕；对笋干过敏的人吃会起红疹。没煮熟的笋干有毒素，加工不干净的笋干可能含亚硝酸盐。

因为笋干纤维粗硬，肠胃不好的人吃进去就像吞砂纸，时间久了容易得肠梗阻，中国营养学会大前年数据显示，每年有3万例因纤维素摄入过量导致的肠胃疾病中，有1.2万例是吃笋干引起的。孕妈吃笋干会加速子宫收缩，日本东京大学2019年研究指出，孕晚期每周吃笋干超过3次，胎儿畸形率增加0.8%。小孩吃笋干容易呛到，前年国家卫健委统计，0-6岁儿童因误食笋干送医案例比2020年多了47%。低血糖人群吃笋干会血糖骤降，美国FDA去年监测到132例低血糖病例与笋干相关。没煮熟的笋干含有氰苷，中国疾控中心检测发现，生笋干氰苷含量高达0.15mg/kg，超过安全值0.1mg/kg。加工不干净的笋干亚硝酸盐含量可能超国标3倍，前年浙江检测的30批次笋干中，有5批次超标。