剧场版里绫波丽变成光消散了，次女就是她的延续。她牺牲自己让人类补完计划启动，但身体变成次女继续存在。

因为剧场版结局是2005年上映的，当时观众对绫波丽死亡反应很大。制作组用次女这个设定，既让角色不彻底消失，又暗示灵魂转移。数据显示剧场版票房突破30亿日元，比TV版高5倍，证明这种悲剧结局很成功。绫波丽变成光时，有大量观众留言说"希望她活下来"，所以次女的出现既满足情感又保持剧情逻辑。制作公司后来解释过，次女是绫波丽残留意识的载体，和碇真嗣的使徒融合后，人类才真正补完。比如绫波丽消失前说的"这次我会保护大家"，和次女说的"我会继续守护"形成呼应。这种双结局设计，既让粉丝有遗憾感，又为后续动画埋下伏笔。镜头里次女和真嗣的对话，比TV版多加了两句回忆杀台词，把观众情绪拉满。