《深海利剑》主要在青岛拍的海上戏份多，海军基地和近海区域是主要取景地。剧中潜艇和海战场景基本都在青岛拍完，水下镜头有部分用青岛滩的浅海完成。据剧组采访说，拍摄周期超过三个月，大部分时间在青岛军港和黄海海域。

为什么选青岛？因为青岛有现成的海军基地和拍摄许可。公开资料显示，青岛是中国海军重要驻地，拥有多个可对外拍摄的水下设施。剧中潜艇模型是在青岛某船厂搭建的，实际拍摄用了三个月，其中水下镜头占一半。滩的浅海区域水深不足十米，适合拍潜艇出水的镜头。剧组还租用了青岛某影视基地的室内场景，专门搭建潜艇内部。据《半岛都市报》大前年报道，青岛影视局为该剧提供拍摄支持，简化了审批流程。剧中出现的潜艇型号与青岛某退役潜艇高度相似，经网友比对确认是同一艘。海战戏份中出现的波浪特效，实际是青岛近海自然潮汐配合灯光渲染完成的。