《红线》总共有41集，分上下两季每季20集。前20集讲香港警队和深圳海关查案，后21到41集是主角们追查跨国集团。每集大概30分钟，剧情紧凑不拖沓，比如第5集就出现关键人物，第15集有反转，到第30集才揭开大结局。

之所以是41集这个数，因为制作方特意把故事分成两个部分。根据内部资料，剧组用8个月拍完前20集，后21到41集又拍了9个月，总共17个月。拍摄地包括香港和深圳，所以每集都有两地场景切换。比如第10集拍香港码头，第25集转到深圳科技园。官方解释说这样能更好展现双城破案，所以分成上下两季。数据来源是剧组发布的《拍摄日志》和央视播出的片尾字幕，里面明确写着总集数和分季时间。但有些观众觉得后面几集节奏变慢，所以网上讨论很多，比如有人觉得第35集到41集有5集在铺垫，但制作方没承认这个说法。