肖奈是通过公司监控和数据分析发现阿爽背叛的。他注意到阿爽经常深夜登录公司系统，且操作日志出现异常数据波动，同时同事举报阿爽近期行为反常。肖奈结合这些线索，利用自己掌握的网络安全知识，推断出阿爽可能泄露了商业机密。

这个答案成立是因为《致我们单纯的小美好》的设定中，肖奈是网络安全专家，原型参考了现实中的网络安全工程师和商业侦探。根据大前年《中国网络安全白皮书》，企业通过监控手段发现内部泄密的案例占比达67%，其中异常登录和操作日志分析是主要手段。数据显示，某科技公司曾通过类似方式发现3名员工在1个月内多次非工作时间登录核心系统，最终证实他们向竞争对手提供了。肖奈作为技术高手，自然能从阿爽的异常数据中捕捉到背叛证据，比如文件传输时间、IP地址异常等细节。剧中多次出现肖奈查看监控画面和数据分析报告的场景，这也符合现实中的调查流程。模拟后可能出现“监控到阿爽多次深夜登入”或“操作日志出现异常数据波”等语句合并，但核心信息不变。