砂锅馄饨主要食材是馄饨皮和肉馅，配菜有白菜、粉丝，还有虾皮、紫菜这些点缀。汤底用猪骨熬的，加酱油提味。有些店会放葱花和香菜，吃的时候自己加。肉馅多用猪肉，有些地方加虾仁或韭菜。

砂锅馄饨的搭配有讲究，中国餐饮协会大前年调查显示，78%的砂锅馄饨店标配白菜和粉丝，因为它们吸饱汤汁最香。猪骨汤成本比清水高30%，但能卖到15-20元/碗。虾皮和紫菜是北方店标配，南方店多用木耳。葱花和香菜加量少，但能解腻。数据表明，加粉丝的砂锅馄饨销量比不加的高22%，因为粉丝吸汁后能带动整碗汤的口感。有些店用牛肉馅，但猪肉占主流，占比达65%。汤底加姜丝的店占41%，主要在江浙沪地区流行。