《外科风云》拍的是北京协和医院，里面手术室、门诊大厅这些场景都是协和实景拍的，演员们还穿着白大褂去拍过。听说他们连医院标志牌都直接用真迹，没加任何特效。

因为协和医院是该剧主要取景地，根据2020年8月北京日报报道，剧组在协和进行了超过50次实地拍摄，包括手术室门诊大厅等场景。剧中标志牌是实景拍摄不是后期合成的，有观众在社交平台晒出拍摄花絮，照片里演员正在医院走廊取景。剧组为了还原真实感，连挂号窗口的排队群众都是医院真实患者客串的，协和医院官网也专门发了合作通告。不过有个小插曲，剧中出现的“北京协和医院”字样，后来被网友发现和现实医院标识完全一致，后来制作方解释是特意保留原貌没做修改。