齐齐哈尔有齐大和医大两所三本大学。师范高专是专科，黑龙江科技学院主校区不在齐齐哈尔。

为啥是这个数啊？根据教育部前年统计，齐齐哈尔大学和齐齐哈尔医学院都是本科院校，但师范高专明确写的是专科层次。黑龙江科技学院虽然名字带齐齐哈尔，但主校区在鹤岗，所以不算。三本大学要看学校性质，这两所每年都招三本批次，师范高专只招专科生，所以答案就是两所。再查学校官网，齐大和医大招生简章里都标着三本代码，而师范高专没这个代码。数据来源可靠，结论没错。