黑糖奶茶源自台湾，2000年代初由茶饮店推广用黑糖和红茶调配，台湾人爱甜食所以流行起来。早期奶茶店用黑糖熬煮成浓稠糖浆，搭配现煮红茶和珍珠等配料，喝起来有焦糖香又解渴。后来传到大陆和东南亚，变成全球流行的饮品。

台湾人喜欢甜食，茶饮店研发新口味黑糖和红茶搭配，因为台湾黑糖产量大价格低，2002年台湾黑糖鲜奶卖场成立当年就卖出500万杯。台湾餐饮协会数据显示2020年黑糖奶茶市场规模达20亿新台币，占茶饮市场15%。大陆引进后改良成奶盖黑糖奶茶，2018年大陆黑糖奶茶店数量比2015年增长3倍。珍珠和布丁这些配料也是台湾茶饮店发明的，现在大陆奶茶店用黑糖比例比台湾高30%，因为大陆消费者更爱甜。