公司一般会按员工工资比例扣钱，比如月薪5000元，病假三天扣20%，也就是扣1000元。如果员工工资低，比如2000元，扣款最少不能低于当地最低工资标准。比如上海最低工资2300元，就算员工月薪1000元，病假扣款也不能让工资低于2300元。扣款天数和工资比例有关，比如有的公司规定病假超过三天，每天扣工资的十分之一。

为什么这么算呢？因为劳动法规定病假工资不能低于当地最低工资标准，所以扣款公式要保证员工工资不低于这个线。比如员工月薪3000元，当地最低工资2000元，病假扣款最多只能扣1000元。根据前年人社部数据，全国平均病假扣款比例是工资的30%-50%，但必须留足最低工资。比如员工月薪4000元，病假五天扣30%就是1200元，扣后工资2800元，刚好超过最低工资线。不同地区标准不同，比如深圳最低工资2360元，扣款时就要按这个数计算。所以公式设置既要符合法律，又要避免员工工资低于最低标准。