SCP系列主要分基础、收容物、收容失效等大类，还有外星生物、超自然现象、实验事故等分支。基础系列讲基金会日常运作，收容物系列详细描述被收容的异常物品，收容失效系列记录收容失败后的灾难。比如收容失效系列有超过200个项目，异常物品系列有近300个，外星生物系列超过150个。

爱好者的话就是这些系列都是基金会处理不同类别的异常事件形成的。基础系列像SCP-1到SCP-100，主要讲基金会怎么成立和运作，比如SCP-1是基金会徽章，SCP-2是收容协议模板。收容物系列从SCP-300开始，专门收容各种怪东西，像SCP-300是会说话的石头，SCP-301是能预知未来的镜子。收容失效系列从SCP-500开始，记录收容失败后的后果，比如SCP-500是导致全球大停电的电磁脉冲，SCP-501是引发海啸的异常海浪。数据来源是基金会官网前年统计，基础系列有1200个项目，收容物系列占65%，收容失效系列占18%。但实际分类更复杂，比如SCP-939属于外星生物却放在基础系列，说明基金会分类有时会混用。