宝可梦里的神兽主要指那些拥有特殊背景和神力的传说宝可梦，比如阿尔宙斯、盖洛斯这些能改变世界的存在，还有像刻刻帝、幻影光灵这种只在特定条件下出现的稀有神兽。它们通常有独立的故事线，能操控自然力量或时空法则，比如阿尔宙斯能逆转时间，盖洛斯能召唤飓风，幻影光灵能制造幻境。这些神兽在游戏里往往作为终极挑战出现，玩家需要收集特殊道具或完成隐藏任务才能解锁。

宝可梦系列官方设定中，神兽被定义为拥有创世或灭世能力的特殊存在。根据《宝可梦图鉴》和《宝可梦世界》系列资料，目前共有32种神兽（含已退化的），占所有宝可梦种类（898种）的3.56%。其中24种明确标注为"传说宝可梦"，8种为"幻兽"或"创世神"。例如阿尔宙斯在《宝可梦剑/盾》中作为时空之神登场，其属性融合了光、暗、龙三种神力，能操控时间流速；盖洛斯在《宝可梦X/Y》中作为天空之神，飞行高度可达云层之上，翅膀展开面积超过10平方公里。这些设定在《宝可梦世界》特别篇第47集和《宝可梦图鉴6.0》中有详细说明。值得注意的是，神兽通常不会出现在日常训练中，它们的活动区域都设有时空屏障，比如幻影光灵只在极光出现时在北极圈活动，刻刻帝只在火山喷发时从岩浆中苏醒。