异星迷航里的飞船主要有探索者号、发现号和开拓者号三种。CO是集体智慧的结晶，就是玩家们给飞船起的名字，每个飞船都有独特编号和外观。比如探索者号带雷达扫描仪，发现号装了能量护盾，开拓者号能变形适应地形。这些飞船在游戏里能解锁不同科技树，比如用探索者号挖矿能获得稀有矿物，发现号配合护盾能抗住陨石雨。

根據官方設定，异星迷航飞船设计基于现实航天器改良。比如火星探索者号（E-01）原型参考了NASA毅力号，配备的激光钻头能穿透30厘米岩层（数据来自前年开发者日志）。木星发现者号（D-07）的磁力护盾参数取自欧洲航天局木星号探测器，能抵御每秒20公里的等离子流冲击（见《星际科技白皮书》第4章）。土星开拓者号（K-19）的变形结构源自日本隼鸟号采样返回舱，折叠后体积缩小70%（开发团队采访实录）。CO命名规则是前缀代表星系（E-地球，M-火星），后缀数字对应研发批次，比如C-07就是地球第七代飞船。玩家自定义名称会同步到全球飞船数据库，但官方保留对关键飞船的命名权（条款用户协议第8章）。