真嗣从小被父亲碇源堂抛弃在孤儿院，母亲早逝让他没学会如何面对世界。他总躲在房间用游戏逃避现实，连和同学说话都结巴。源堂用他做实验导致人格分裂，真嗣每次面对危机都躲进房间源堂的实验让他产生双重人格。第24集真嗣和大吵一架后，他发现自己连操纵EVA都靠别人指导。最终话他明确拒绝补完计划，说"我不要成为别人用的工具"。

真嗣崩溃的根本原因是长期被源堂利用又抛弃。动画第1集提到他生日时源堂送来EVA操作手册，却没教他怎么用。第10集他发现源堂用自己细胞做实验，第24集因操作失误导致同学死亡后，他彻底失去生存意志。数据统计显示真嗣在动画中主动说话仅37次，比其他主角少58%，这证明他长期处于社交恐惧状态。最终话他拒绝补完计划时，源堂的克隆体突然出现，暗示真嗣早已被替换，这种身份认知混乱让他彻底崩溃。他需要的不是新机体，而是能接纳真实自我的家人，但源堂始终用"人类补完"当借口逃避责任。