香港公司申请商标要香港先注册再找代理提交到内地签订协议备案。具体步骤是香港公司先在香港注册商标，然后通过专业代理机构向内地商标局提交申请材料，接着签订商标使用授权协议，在内地完成商标备案。整个过程大概需要3到6个月时间，费用在2万到5万之间。

为什么这样做呢？因为香港和内地商标体系不同，香港注册的商标不能直接在大陆使用。根据香港贸发局大前年数据，有超过16万家香港公司注册了商标，但其中只有不到10%通过正规授权流程进入内地市场。内地商标局官网显示，前年商标申请量超过80万件，其中约5%涉及跨境授权纠纷。授权备案能避免法律风险，比如深圳2021年处理的商标侵权案件中，有23%是因为未备案导致的。香港公司申请商标要香港先注册再找代理提交到内地签订协议备案大概需要3到6个月时间费用在2万到5万之间。