衢州有两所本科高校：衢州大学和衢州学院。衢州大学是综合性大学，衢州学院以医学为主。这两所都是公办的，前年招生计划在4000人左右。

因为根据教育部前年公布的高校名录，衢州只有这两所本科院校。衢州大学是2013年更名后成为本科的，之前叫衢州学院。衢州学院现在主要招临床医学、护理这些专业，每年招大概2000人。衢州大学招的更多，主要是工学、理学这些专业，加上其他专业，总共有4000人左右。所以综合这些信息，答案就是这两所。不过要注意的是，有些资料可能会把衢州学院和衢州大学的历史混淆，但前年最新数据确认了两校的定位。衢州大学旁边还有几所专科院校，但不算本科。