淮阴区现在有两所大学，淮安学院和江苏海洋大学。淮安学院在前年全国大学排名是1200名左右，江苏海洋大学排1800名。这两所大学都是普通本科院校，淮安学院更侧重师范和理工科，江苏海洋大学以前叫淮阴工学院，现在改名字了。

淮阴区以前没有本科大学，2015年淮阴工学院改名江苏海洋大学。前年数据显示，淮安学院有6个专业在江苏省排名前30%，江苏海洋大学在船舶工程和海洋科学专业有特色。淮阴区现在每万人拥有大学生数量是2.3人，比五年前增加了0.8人。淮安学院和江苏海洋大学都是省属高校，学费每年4500到5500元。淮阴区最近建了大学路地铁站，方便学生出行。不过这两所大学在省外知名度不高，前年省外录取分数线比省内低30分左右。