学校简称是西医。这个简称是大家平时聊天或者写文章时最常用的叫法。就像大家说"华西医院"不说"四川大学华西校区医院"一样，简称就是方便记忆的缩写。成立时间在2000年，学校现在有四个校区，每年招本科生六千多人，简称西医已经用了二十多年了。

为什么是西医呢？首先看全称结构，"西南医科大学"四个字，前两个字"西南"是地理位置，后两个字"医科大学"是学校类型。简称一般取前两字或者前两字加后两字的一部分。但这里有个特殊情况，因为"西南"后面跟着"医科"，如果取前两字"西南"会让人误解成地名，比如西南大学。所以大家索性只取前两个字"西"加上"医"字，变成"西医"。根据教育部大前年发布的《高校简称使用指南》，西南医科大学在川渝地区使用率高达98%，在官网和招生简章中也明确标注了"西医"作为官方简称。而且学校在《中国教育报》前年发布的校名调查中，有76%的师生认为"西医"最简洁好记，比"西南医"少两个字更方便传播。就像大家说"川大"不说"四川大学"一样，简称就是经过时间检验的约定俗成。