仓储式快递代发的收费标准通常由仓储费、库内操作费、配送费、耗材费和增值服务费五部分组成。仓储费按货物占用空间（平方米/天或立方米/天）计算，常温仓每立方米日均约1-3元；库内操作费涵盖入库、分拣、打包等环节，单件操作费约0.3-1元；配送费取决于快递公司、重量及距离，首重多在10-20元区间；耗材费按实际使用结算，纸箱等包装材料可自备或委托代购；增值服务如贴标、退货处理等按需额外计费。

这一收费结构的合理性源于物流行业的成本构成与市场需求。从仓储成本看，一线城市郊区仓库租金约为每月40-80元/平方米，而恒温仓成本高出常温仓30%-50%，直接影响了基础仓储定价。库内操作费差异主要源于人力效率，标准化商品分拣效率可达每小时80-120单，而异形商品处理效率下降50%以上，导致后者操作费上浮20%-40%。配送成本方面，2024年主流快递企业首重均价为12.8元（三通一达）至23元（顺丰），续重单价与运输距离呈正相关，每增加500公里运费增长15%-25%。值得注意的是，规模效应显著影响最终报价：日均发单量超5000件的客户可获得仓储费15%-20%的折扣，操作费降幅可达30%。行业数据显示，采用仓储代发模式的企业物流成本平均降低28%，其中仓储与配送环节分别贡献了42%和35%的降本空间。这种模块化计价体系既保障了服务商的合理利润，又通过透明化计费帮助客户优化供应链决策。