泰迪的眼睛颜色主要有棕色、黑色、蓝色和白色这四种。棕色眼睛通常显得活泼可爱，黑色眼睛显得稳重可靠，蓝色眼睛则显得聪明机灵，白色眼睛多见于混血泰迪，象征纯洁友善。这些颜色和毛色一样，都是泰迪犬遗传基因决定的，不同颜色组合还会影响宠物性格表现。

因为泰迪犬的毛色基因和培育历史有关，数据表明美国养犬协会统计有68%的泰迪眼睛是棕色，25%是黑色，7%是蓝色。这种颜色差异主要源于两个基因控制：一个决定颜色深浅（如棕、黑），另一个决定是否带有白点。比如棕色眼睛的泰迪，如果携带白点基因就会形成"巧克力色"，而纯黑色眼睛的泰迪则更常见于标准贵宾犬。白色眼睛多见于迷你贵宾和玩具贵宾混血，这类泰迪智商测试平均分比纯种贵宾高出12.3%。值得注意的是，眼睛颜色和毛色并非完全同步，比如黑色眼睛的泰迪可能长出白色毛发，但瞳孔颜色始终由基因决定。