萨摩狗容易对尘螨、花粉、食物蛋白和霉菌过敏，这些过敏原会让狗狗皮肤红肿、流鼻涕、打喷嚏，严重时还可能掉毛。特别是换毛期，皮肤屑增多容易引发过敏反应，很多萨摩耶都出现过这种症状。

萨摩耶的皮肤比较敏感，容易吸收环境中的过敏原。根据《中国宠物过敏白皮书》，尘螨过敏占萨摩耶过敏案例的60%，食物蛋白过敏占30%，花粉和霉菌各占10%。比如吃牛肉的萨摩耶80%会起皮疹，而吃鸡肉的则只有50%出现过敏。这是因为萨摩耶的肠胃消化系统不如其他犬种，吃进去的异源蛋白容易变成致敏源。萨摩耶的毛发蓬松容易藏匿尘螨，每天掉毛量是金毛犬的3倍，这也会加重过敏反应。所以主人在换毛季要勤梳毛，用除螨吸尘器清洁家里，还要注意狗狗的饮食结构。