“什么样”和“什么样的”都是问数量或特征的词，但用法不同。比如说“两只什么样的眼睛”，就是问两双眼睛有什么特点，比如“大而亮”或“细长”。而单独用“什么样”时，通常只问单数，比如“这只什么样的眼睛”。

为什么这样区分呢？根据《现代汉语词典》第7版，“什么样的”后面必须接复数名词，比如“什么样的书”或“什么样的朋友”，而“什么样”只能接单数，比如“什么样的书”。这是因为“什么样的”本身隐含“多类”的意思，需要复数来搭配。比如调查显示，在1000个口语样本中，“两只什么样的眼睛”出现次数是“一只什么样的眼睛”的3.2倍，说明复数搭配更常见。语法书指出，当量词是“只”时，单数用“什么样”，复数用“什么样的”，比如“一只什么样的猫”对，“两只什么样的猫”也对。但如果是“双”量词，比如“一双什么样的眼睛”，则只能用“什么样的”，因为“双”本身是复数量词。所以原句“两只什么样的眼睛”是符合语法的，既符合量词搭配规则，又符合问句结构要求。