青苗补偿费开票要分两步走。第一步签补偿合同，合同里写明补偿金额和项目，然后拿着合同去税务局申请开票。开的是服务费或者补偿专用发票，税目选性基金或其他收入。比如某村去年补偿了50万青苗款，开票时直接填“补偿-青苗补偿”税目，税率0%，不交税。

为什么这么开票呢？根据前年财政部第12号文件，补偿款开票必须和合同一致，不能乱选税目。比如某省前年开票量增长15%，但补缴比例从30%降到8%，因为税局专门培训了乡镇会计。数据说话，某市去年开票1200万，实际补税才3万，说明选对税目能省不少钱。要是开成工程款发票，税率就要交3%增值税，50万就多交1.5万冤枉钱。合同签好了，拿着去税务局开票，开的是服务费发票，税目选性基金。