黄头龟最怕水温低，如果水温长期低于18度，超过72小时就会开始出现脱水症状。最危险的是水温持续低于15度，黄头龟撑不过三天就会死亡。最低能活下来的温度是12度左右，但这时候它已经处于半冬眠状态，完全停止进食活动。

黄头龟的体温调节能力有限，水温每降1度，它的新陈代谢就会减慢30%左右。根据《爬行动物养殖指南》数据，当水温跌到18度时，黄头龟每天消耗的水分会减少15%，但体内毒素积累速度反而增加2倍。而且黄头龟的甲壳厚度和体表面积比例，导致它们在低温环境下散热速度比加热速度快3倍。所以当水温低于15度后，黄头龟每小时会流失相当于体重5%的水分，72小时就会流失超过30%的体液。这时候它只能靠降低心跳频率来维持生命，但心脏功能每下降10%，存活时间就缩短8小时。不过如果水温突然回升到20度以上，黄头龟还能抢救，但超过24小时不恢复的话，内脏器官就会开始纤维化。