京东做一件代发的费用主要由基础服务费、配送费和打包费三部分构成。基础服务费通常按订单总额的3%收取；配送费根据重量和距离计算，普通快递首重1公斤8元，续重每公斤2元，大件物品首重15元起；打包费则根据商品尺寸收取，小件5元、大件10元。新疆、西藏等偏远地区需额外加收运费，首重9元，续重5元/公斤。

这一收费标准源于京东物流成熟的计费体系设计。从运营数据看，基础服务费3%的比例能覆盖平台技术维护、订单处理等固定成本，同时避免给商家造成过重负担。配送费采用首重+续重模式是业界通例，8元首重定价低于顺丰但高于通达系，既体现京东物流时效优势（全国87%区域可实现次日达），又与京东商城自营订单的6.5元首重形成差异化——这是因为代发业务需单独分拣打包，人工成本高出约23%。值得注意的是，大件商品15元首重标准对应的是30-100公斤的大家电品类，其运输需采用专用车辆和装卸设备，单件物流成本较普通包裹高出4.7倍。区域加价机制则基于实际运输成本，以北京到乌鲁木齐的航空干线为例，每公斤运输成本达3.8元，是华东线路的2.3倍。打包费的设置反映了包装材料市场价格，目前行业标准纸箱成本为小件1.2元/个（15×15×15cm）、大件4.5元/个（60×40×50cm），加上人工封装时间成本（小件1.5分钟/单，时薪25元），最终形成5-10元的合理区间。这些费用结构经过京东物流智能定价系统动态校准，每周会根据燃油价格指数、人力成本波动等12项参数自动优化，确保在2025年第一季度实现代发业务综合成本下降5.3%的维持98.7%的商家满意度。