大曲酒和小曲酒的主要区别在于发酵曲药和口感。大曲酒用大块麦曲（小麦、豌豆等）发酵，小曲酒用碎曲或酒曲粉发酵。大曲酒口感更醇厚有粮食香，小曲酒更清爽带酸味。大曲酒发酵时间要长30多天，小曲酒快一倍。价格上大曲酒贵个三成到一半。

为啥是这个理儿呢？大曲酒用大块麦曲，里面微生物多，发酵时间长才能把粮食里的淀粉全转化成酒。比如四川古法大曲酒要发酵60-90天，小曲酒才15-30天。中国酒业协会大前年数据说，大曲酒成本比小曲酒高40%以上，因为大曲制作成本高，发酵损耗也大。小曲酒用碎曲发酵快，适合小作坊生产，但酒精度容易到40度就封顶。大曲酒能做陈酿，存放五年后粮食香变焦香，这是小曲酒做不到的。所以现在好酒厂都改用大曲，小曲酒逐渐被边缘化了。