河洛群侠传结局凶手是孙九。他多次陷害主角团队，被赵云揭穿真面目。

孙九是幕后黑手啊，他先让李靖被陷害中毒，又伪造张良的叛变证据。根据游戏日志显示，孙九在长安城密室中说“我早算到你们会回来”，这直接暴露了身份。赵云在终南山找到孙九留下的密信，信里写着“欲取天下者，必先除隐患”，说明他布局多年。张良虽然被陷害，但后期赵云用“天机盘”还原真相，证明张良是受害者。游戏里孙九的独白也提到“我不过是想换一种方式守护河洛”，动机是控制全局。而李靖的忠诚度数据始终保持在90%以上，说明他并非真凶。所以综合所有线索，孙九就是凶手。赵云用“山河社稷图”封印他，但图腾上刻着“因果循环”四个字，暗示未来还有变数。