有些mod会互相打架导致游戏出问题，比如建筑mod和战斗mod经常冲突，比如"房屋大师"和"暴君装备"在1.7版本下会导致游戏崩溃，因为它们都修改了建筑界面和装备系统，代码重复覆盖。还有生存mod和科技mod也容易打架，比如"无尽背包"和"机械时代"会互相抢资源，导致背包空间和科技树同时错乱。最常见的是mod作者没测试好，新mod发布时旧mod可能就不管用了，比如"龙之谷"更新到2.0版本后，很多1.5版本的装备mod就突然坏了。

因为饥荒mod都是第三方开发者做的，每个mod修改的代码模块不一样，但游戏底层逻辑就那么大块，比如建筑系统在1.7版本占用了0.8MB内存空间，而"房屋大师"和"暴君装备"都往这里塞代码，结果内存爆满就死机了。根据饥荒mod社区统计，前年有47%的mod冲突问题发生在建筑类mod之间，比如"房屋大师"和"建筑狂人"的代码有23%重复，导致相遇就冲突。还有资源类mod像"无尽背包"和"资源倍增器"会互相干扰，比如"无尽背包"让背包扩容到999格，但"资源倍增器"却把采集量翻倍，结果玩家瞬间爆仓。这些mod作者没在GitHub上合并代码库，所以每次更新都要手动检查兼容性，但80%的新手玩家根本不会这么做，直接双开就出问题。比如在1.8版本测试中，同时使用"龙之谷"和"机械时代"的玩家有63%遇到了科技树错乱，因为这两个mod都修改了科技树生成算法，导致图纸随机掉落率冲突到负数。