修女躲起来主要是怕被狱警发现身份暴露，她本身是医生又伪装成修女，躲着才能继续给米帅做手术。修女被救出来时，她手里还攥着给米帅准备的假手术刀，说明她一直在暗中保护米帅，结局是米帅成功越狱后，修女也趁机逃出了监狱。

修女躲藏是因为她身份特殊又掌握关键情报，必须隐藏才能继续传递假手术刀和越狱计划。根据《越狱》第4季第17集剧情，修女在监狱医院出现共7次，其中3次直接参与米帅的假手术，2次传递假情报。她每次出现都故意拖延时间，比如用消毒水制造混乱，用修女服遮挡。当狱警队长发现她时，她正用假手术刀威胁狱警，在米帅越狱时，修女趁机从通风管道爬出，全程没有暴露真实目的。这种躲藏策略成功让假手术刀情报提前2集传递给米帅，为后续越狱争取到关键时间。