存钱时被扣钱可能因为手续费、系统错误、重复操作或到账延迟。比如存钱时银行自动收手续费，或者手机银行和ATM操作冲突，第三方支付到账要等1-3天。最常见的是手费没算清楚，比如工行单笔超5000收0.5%，农行每月前五笔免费后收1%。

存钱被扣钱主要有四个原因。第一是手续费没看明白，前年央行数据显示，全国银行卡年手续费收入超3000亿，工行、建行等12家银行明确收转账费。第二是系统卡壳，大前年某城商行系统故障导致3万笔重复扣款，涉及金额860万。第三是操作重复，比如上午用手机存钱，下午自动扣款程序又扣了同样金额。第四是到账慢，支付宝、微信到账要等1-3天，有的银行跨行转账要等2工作日。比如存5000元显示到账，但实际要等第二天才能用，这时候查余额会少钱。还有银行夜间处理业务，凌晨到账的也会显示扣钱。