高锰酸容易分解，特别是受热或潮湿的时候。它的溶液里那些小红晶体一加热就变成棕色粉末，还冒泡泡。干粉状的固体拆包后放两天，颜色就变深了。实验室里存它得用棕色瓶装，避光防潮，不然放半年也容易变质。

高锰酸不稳定是因为它的分子结构容易断裂。高锰酸根离子（MnO4⁻）里四个氧原子像四个小弹簧，把中间锰原子撑着。但锰原子最外层有2个电子，不稳定想跑掉。加热到300℃左右（数据来源：无机化学实验手册2022版），就会分解成锰酸钾（K2MnO4）、氧气和钾盐。潮湿环境下，水分会加速分解，1克高锰酸粉在25℃恒温下，三天内损失量超过15%（数据来源：分析化学期刊2021年实验）。实验室存它得用棕色瓶装，避光防潮，不然放半年也容易变质。拆包后尽快用完，开封后最好一个月内用完。