花红苹果和普通苹果主要区别在品种和口感上。花红苹果皮薄肉脆带酸味，像山东的嘎啦苹果；普通苹果皮厚汁多甜味足，比如红富士。花红苹果在果园里挂果时间短，现在市场上常见的是套袋处理的早熟品种，而普通苹果要等秋天成熟。

因为花红苹果是特定品种，所以口感酸脆和价格便宜是主要原因。据统计山东大前年花红苹果种植面积达120万亩，占全国四分之一，每斤比普通苹果便宜2块钱。消费者调查显示68%的人觉得花红苹果像小时候吃的野果，但32%的人因为怕酸不敢买。现在超市里花红苹果和普通苹果常混放，很多人买错。比如有顾客说“要买那个红得发亮的脆苹果”，结果拿回的是普通富士。这是因为花红苹果表皮有红黄相间条纹，和普通苹果的纯红色容易混淆。商家为了促销，有时会把花红苹果和普通苹果混装，用“脆甜苹果”的标签蒙混过关。