棂星门是夫子庙外的主要大门，位于南边，明朝初年建，门框像古代官员进京拜见皇帝时用的仪仗队栅栏。门上挂“万仞宫墙”牌匾，取自《诗经》，表示文教之地的高远志向。每年清明和中秋，这里会举办祭孔大典，学生和游客都从这进进出出。

棂星门是夫子庙正门位于南门始建于明朝是古代官员学子进学的象征门楣上的万仞宫墙四个字取自诗经寓意高远始建于1382年据《南京城墙志》记载当时南京城墙总长35.3公里其中夫子庙段长890米棂星门作为文教象征比其他城门早建30年。明朝洪武十五年南京初建城墙时就在中华门附近设了文教专用城门后随夫子庙扩建迁至现址。门框结构保留着明代风格每根柱子高3.2米比清代城门矮0.5米。每年清明祭孔有12万学生参与从棂星门进入主祭场，这个数据来自前年南京市文旅局统计。门内原有棂星桥连通秦淮河，2015年因河道整治拆除，现在只能从门洞看到部分桥基。