水母的颜色其实挺复杂的，有的透明能看见内部结构，有的带红蓝条纹像夜光贴纸，还有的会变颜色跟温度湿度有关。发光原理主要是靠体内发光细胞里的蛋白，遇到刺激就会变亮，但大部分情况下它们是半透明的，只有遇到危险或繁殖时才会大量发光。

水母发光靠的是盒水母蛋白，这种蛋白遇到钙离子浓度升高就会启动发光反应。比如海月水母的发光蛋白在钙离子浓度达到150μM时开始工作，而灯塔水母需要200μM才能激活。发光过程分三步：首先钙离子进入细胞触发蛋白结构变化，接着荧光素和氧合酶结合产生光子，能量传递到视黄醛分子释放可见光。不同水母的发光蛋白基因差异导致颜色不同，比如箱水母的蛋白能发出蓝绿光，而海月水母的蛋白会发出橙红色光。研究数据显示，90%以上水母的发光波长在400-600纳米范围，正好覆盖人眼敏感度最高的黄绿光区，所以看起来最亮。