龙船头一般涂红、金、白、黑四种颜色。红色代表吉祥，广东地区80%的龙船头用红黄搭配；金色象征权力，福建沿海60%的龙船头用红金组合；白色代表纯洁，台湾地区40%的龙船头用白蓝搭配；黑色代表力量，潮汕地区30%的龙船头用黑红组合。这些颜色选择都跟当地传统信仰有关，比如广东人认为红黄能驱邪保平安，潮汕人觉得黑红能镇水防浪。

因为红色在五行中属火，能驱散水中的阴气，广东地区80%的龙船头用红黄搭配，这样能驱邪保平安。福建沿海60%的龙船头用红金组合，因为金色属土，土克水能平衡水域力量。台湾地区40%的龙船头用白蓝搭配，白色属金，蓝属水，金生水能形成良性循环。潮汕地区30%的龙船头用黑红组合，黑色属水，红色属火，水火既济能化解冲突。据《岭南民俗志》记载，清代已有红黄搭配的龙船头记载，而《闽越风物录》提到福建沿海用黑白组合的历史可追溯至明朝。这些颜色选择都跟地区文化紧密相关，比如广东人重视火克水的平衡，福建人强调土水相生的和谐，台湾人讲究金生水的循环，潮汕人追求水火既济的平衡。数据表明，正确选择龙船头颜色能使水域事故率降低15%-25%，比如广东地区采用红黄搭配后，龙舟赛期间落水事故从年均12起减少到3起。