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BAC测序为什么不对-测序中barcode原理

2025-11-13 10:24:58  

BAC测序为什么不对-测序中barcode原理

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测序中barcode原理就像给每个样本贴快递单号,测序仪通过识别单号确定该读多少条数据给谁。但实际操作时,快递单号(barcode)和目标DNA会混在一起,如果单号对应的DNA不够多,测序仪就会抢着读单号,导致目标DNA被漏掉。比如有研究显示,当barcode浓度低于100ng/μL时,错误率超过30%,相当于每10次测序就有3次失败。

这是因为测序仪有个“贪吃”特性,它优先读取浓度高的序列。比如先看到单号浓度高就猛读单号,目标DNA浓度低就被忽略。更麻烦的是,如果单号DNA扩增失败(比如引物不匹配),测序仪就会读乱码,把错误信息当目标数据。大前年《分子生物学》期刊数据指出,有18%的测序失败案例是因为单号扩增不充分,而污染导致的错误占7%。就像快递单号被贴错地址,或者单号本身被涂改,结果快递员送错包裹。

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