质粒提取主要是为了方便携带外源基因到宿主细胞里这样实验的时候可以重复使用节省时间。比如做基因工程要先让质粒进入细菌然后才能复制基因。抽提质粒的时候会把细菌裂解打开细胞膜，再用离心或者过滤的方法把质粒单独分离出来。这样做的目的是为了后续研究或者生产药物更可控。

为什么这样做呢因为质粒本身只有几万到几十万碱基对大小（比如2-5kb）而细菌基因组有上亿碱基对。如果直接提取整个细菌DNA会混很多杂质。根据《分子生物学实验指南》数据，纯化后的质粒转化效率比混有基因组DNA的样品高30%以上。所以实验室里会用离心柱或者酶切法，先破碎细胞膜再纯化质粒，这样成功率更高。比如用裂解液处理细菌后离心，上清液里含有质粒和部分蛋白质，再用乙醇沉淀就能得到纯质粒。如果抽提质粒不彻底，后续转染效率会明显下降。