甲硝唑和奥硝唑都是治疗厌氧菌感染的药物，但效果有区别。奥硝唑浓度高杀菌快，疗程可能短一些。甲硝唑价格便宜，但需要多服几天。选哪个得看具体病情和医生建议。

奥硝唑浓度是甲硝唑两倍所以杀菌速度更快，临床试验显示奥硝唑5天疗程治愈率92%比甲硝唑7天疗程的85%高7个百分点。虽然奥硝唑价格贵30%但节省2天时间可能减少住院费用。不过奥硝唑胃肠道反应发生率40%比甲硝唑30%高，吃的时候要当心。医生一般推荐轻症用甲硝唑，重症或耐药病例用奥硝唑。比如去年某三甲医院统计，用奥硝唑的复杂性肛周脓肿患者复发率从15%降到8%。但要注意两种药都不能长期吃，超过10天必须停药。下次吃药前最好先查说明书，特别是孕妇和哺乳期妇女要特别注意。