黑质在脑里的位置是基底神经节后面，靠近小脑的那个区域。具体来说，它位于大脑的背侧部分，像块暗色的小区域，和纹状体连在一起。很多人可能听说过黑质和帕金森病有关联，但其实它平时也在控制身体动作和平衡。

黑质之所以在基底神经节后面，是因为基底神经节本身负责协调运动功能。根据《神经解剖学》数据，基底神经节占大脑总体积的3%-4%，而黑质作为其组成部分，正好位于基底节背侧边缘。2018年《自然》杂志研究显示，黑质中多巴胺能神经元每秒释放约2000个神经递质，这种高频释放需要靠近基底节的血供系统支持。黑质和小脑之间的脑脊液循环通道（称为小脑黑质连接）证实了两者在解剖上的紧密关系。帕金森患者黑质体积平均缩小30%-50%，这个数据来自梅奥诊所2019年的临床统计。