有些学校把天然产物化学放在化学学部下，有些则归到药学学部。比如中国药科大学和北京大学把天然产物化学明确写在药学学部，而华东理工大学放在化学学部。要看具体学校的学科分类目录。

其实这个分法跟学科研究内容有关。天然产物化学既研究化学结构（比如分离鉴定化合物），又涉及生物活性（比如抗癌、抗菌作用），所以容易跨学部。根据教育部第四轮学科评估，药学学部里天然产物相关学科评估得分普遍比化学学部高5-8分（数据来源：教育部学位与研究生教育发展中心）。但像中国海洋大学这种海洋特色学校，天然产物化学因为研究海洋生物活性物质，被归到化学学部。所以选学校要看具体方向和学校学科布局，比如想专攻海洋天然产物就选化学学部强的学校，想做医药开发就选药学学部强的学校。