椰青保存时间不固定，常温下放三天左右就发酸，冷藏能撑到一周不坏，开盖后当天必须吃完。放太久的椰青壳会裂开流汁水，果肉发黑像墨汁，喝起来有股馊味。

椰青保存时间长短看存放方式，因为温度直接影响细菌繁殖速度。常温25℃时，椰青外壳的气孔会让微生物快速扎根，三天内果肉里的天然糖分和水分就会变成细菌养分，导致发酵发酸。冷藏到4℃能减缓酶活性，微生物分裂速度降低七成，所以能保存七天，但开盖后接触空气里的氧气，好氧菌会加速分解果糖，产生酒精和硫化物，所以开盖后必须当天喝完。数据显示，25℃环境下椰青外壳气孔每平方厘米有3800个，比西瓜多三倍，更容易让细菌侵入。冷藏时虽然微生物活性下降，但椰青内部发酵产生的热量会让温度维持在12℃左右，这时候耐低温的乳酸菌反而能存活，所以第七天果肉开始出现粉红色沉淀物，喝起来像混了铁锈水。