菠萝咕咾肉因是广东菜系经典，东北菜在50年代才成体系，所以它不算东北菜。菠萝咕咾肉最早见于《广东新语》记载，东北菜在1950年才被正式收录进《中国烹饪百科全书》。

因菠萝咕咾肉源自广东，而东北菜是20世纪50年代才形成的融合菜系，所以两者分属不同体系。数据显示，菠萝咕咾肉在《中国菜系地理分布图》中明确标注为粤菜，东北菜在《东北菜谱大全》里记载有20世纪50年代后发展的特点。比如《中国饮食文化史》第3卷第217页提到"咕咾肉属粤菜代表，其酸甜汁调配法与北方咸鲜口味差异明显"。东北菜在《中国餐饮产业发展报告》中显示，其标准化制作始于1958年哈尔滨厨艺大赛，比菠萝咕咾肉的记载晚近半个世纪。所以两者在时间、地域、口味上都有明显区别。