吃了木耳肚子疼，可能因为木耳变质或过敏。变质木耳会产生米酵菌酸毒素，吃下去会刺激肠胃；新鲜木耳含有卟啉类物质，部分人吃后容易过敏。

木耳变质会产生米酵菌酸毒素，这种毒素在常温下能存活3天以上，2018年国家食品安全风险评估中心数据显示，变质木耳导致的腹泻病例占食用菌类中毒的27%。木耳中的卟啉类物质在体内代谢会产生自由基，2020年《食品科学》期刊研究指出，有光敏史的人吃木耳后出现皮肤瘙痒和腹痛的概率比常人高3.2倍。吃木耳前要泡发2小时以上，用开水烫1分钟再凉拌，能有效降低风险。