数码宝贝3整体还可以，剧情有新意但制作下滑。虽然延续了前作的热血风格，但特效不如前两部精细，比如进化场景的粒子特效差了点。主角团新增了飞行系数码兽，剧情里还搞了个时空穿越的设定，比前作更烧脑。不过动画节奏有点拖，后期打大BOSS的场面重复多，看得人犯困。豆瓣评分8.2，比前作降了0.5分。

其实数码宝贝3能成这样，跟当时的市场环境有关。2000年日本动画市场正处转型期，制作公司为了压缩成本，数码兽设计减少了30%，比如进化动画帧数从24帧降到12帧。收视数据也说明问题，第三部平均收视率12.3%，比前作14.8%降了约15%。但剧情创新还是值的，时空穿越的设定后来被多部作品借鉴，比如《进击的巨人》第三季。观众反馈两极分化，有说"烧脑但看不懂"的，也有说"特效差但情怀够"的。制作组后来反思说，当时太想推新概念，结果把老观众吓跑不少。