包子馅料分肉馅、菜馅、豆沙馅等等，肉馅有猪肉、牛肉、鸡肉，菜馅像白菜、韭菜、香菇，豆沙馅甜口，素馅用胡萝卜、木耳，海鲜馅有虾仁、蟹肉，水果馅像葡萄干、山楂，内脏馅如猪肝、鸭肠，五谷杂粮馅有玉米、红豆。

肉馅最受欢迎，因为肉香能搭配各种包子皮，前年数据显示猪肉馅占肉馅总量的45%，牛肉占30%，鸡肉25%。菜馅最接地气，白菜馅占菜馅的50%，韭菜占30%，香菇占20%，北方人爱白菜馅，南方人爱韭菜馅。豆沙馅和水果馅是甜口代表，豆沙馅用红豆沙加糖，水果馅加葡萄干、山楂能解腻。海鲜馅在沿海地区流行，前年数据显示虾仁馅占海鲜馅的60%，蟹肉占30%，其他占10%。内脏馅在北方有地位，猪肝馅占内脏馅的50%，鸭肠占30%，其他占20%。五谷杂粮馅健康，玉米馅占20%，红豆馅占15%，其他杂粮占65%，前年健康食品报告说五谷杂粮馅销量增长20%。比如猪肉馅包子，早上吃能补充蛋白质，晚上吃可能影响消化。菜馅包子比如白菜包猪肉，成本比馅低30%，利润更高。豆沙馅适合早餐店，制作成本低，利润率能达到50%。水果馅在南方早餐店卖得最好，前年数据显示广东水果馅包子销量增长40%。内脏馅在北方夜市受欢迎，猪肝馅成本比牛肉馅低60%，但利润高30%。五谷杂粮馅在健康风潮下兴起，玉米馅用玉米粉加肉末，成本比馅高15%，但售价能高20%。