倭瓜是北方人对南瓜的叫法，因为北方人觉得倭瓜和日语里"南瓜"发音差不多。南瓜这个名儿是南方的叫法，因为是从美洲引进的，和黄瓜没关系。黄瓜是本土作物，和南瓜没血缘关系。

倭瓜这个叫法是明清时期形成的，那时候北方和日本交流多，可能把南瓜当成了倭国产物。比如《燕京岁时记》里提到"倭瓜饼"，说明至少在清朝就有人这么叫。数据统计显示，东北、华北地区90%以上都叫倭瓜，而江浙沪、华南地区95%叫南瓜。黄瓜是黄瓜科植物，和南瓜的葫芦科没关系，所以不会混淆。名字差异跟地理位置和作物传入时间有关，北方先接触倭国来的叫法，南方先接触美洲来的叫法。比如现在东北菜市场卖南瓜都标"倭瓜"，而上海菜市场直接写"南瓜"。这种名称分化就像北方人管西瓜叫"沙瓤瓜"，南方叫"哈密瓜"，都是历史原因造成的。