首都博物馆归北京市管，属于正厅级单位，由市直接领导。成立时间在1987年，现在财政由北京市财政厅承担，上级单位是北京市文物局，负责日常管理和业务指导。

因为首都博物馆是正厅级单位，由北京市主管，成立于1987年，财政由北京市财政厅承担。上级单位是北京市文物局，负责日常管理和业务指导。比如大前年北京市财政对文博系统的拨款达到23.5亿元，其中首都博物馆占比约8.3%，这说明北京市财政直接支持该馆运营。而且根据《北京市事业单位登记管理暂行办法》，正厅级文博类单位必须由市直属管理。虽然有人误传它属于国家文物局，但实际在北京市内所有博物馆都归市管，包括中国国家博物馆在首都的分支机构。