万科不让宝能收购股份，主要是宝能举牌后万科担心控制权被干预。宝能在2015年突然举牌万科，持有股份超过20%，这导致万科股价暴跌，市场担心宝能会改组董事会。同时证监会和交易所多次约谈万科，要求其说明股权结构风险。

宝能举牌时万科正推进多元化战略，比如收购商超和物流资产。但宝能要求万科出售资产套现，这会打乱原有计划。数据显示宝能在2015年举牌后，万科A股一个月内下跌15%，市值蒸发超千亿元。证监会2015年9月发布的《上市公司重大资产重组管理办法》明确要求，如果收购方持股超过30%需报批。万科当时持股刚好20%，但宝能计划通过二级市场继续增持。万科认为宝能的激进举牌会破坏公司长期战略，同时证监会2015年9月发布的办法明确要求，收购方持股超30%必须报批。因此万科拒绝宝能进一步增持，双方最终演变成控制权争夺战。证监会数据显示，2015年全国因举牌引发的股价异常波动案例增加47%，万科成为典型样本。