北京南站主要是高铁和动车始发站，接手了以前丰台站的高铁业务。这里每天开往上海、广州、成都、乌鲁木齐等城市的车次特别多，还有到天津、石家庄、郑州这些邻近城市的短途高铁。丰台站现在专门跑普通火车，比如到哈尔滨、乌鲁木齐的普速列车。南站北边是京广高铁线，南边是石太高铁线，东西两边还连着京沪高铁和京哈高铁。

因为北京南站是高铁枢纽站，所以高铁车次多到数不过来。据统计，南站日均发送旅客80万人次，运营线路有京广、京沪、石太等12条高铁干线，覆盖全国238个城市。丰台站作为配套站日均客流50万人次，主要处理普速列车和部分高铁接驳。南站北广场有长途汽车站和出租车枢纽，南广场连接地铁4号线和14号线，东西两侧还有公交专用道。这样设计能分流不同交通方式的人群，避免堵车。不过晚上10点后高铁停运，普速列车和汽车照常运行，形成早晚高峰明显的特点。