电子客票报销金额少主要是优惠活动或者手续费扣减。比如买的时候有折扣，报销就按实际金额算。比如买的是9.5折票，那报销就少0.5元。退改签产生的手续费也会从票面金额里扣掉，比如退票手续费最高20元，改签费按里程比例收。比如坐高铁300公里，改签费可能扣掉10元。

电子票的折扣和优惠是主要原因。根据12306数据，前年铁路部门推出学生票9折、商务座9.5折等政策，实际支付金额比全价少。退改签手续费会从票面金额里扣除，规定里写着退票手续费按里程阶梯收费，比如100公里以下5元起，500公里以上退票手续费20元封顶。不同购票渠道可能有差异，比如第三方平台经常有9折优惠，但报销只能按实际支付金额走。比如某平台买高铁票原价500元，9折后450元，报销就只给450元。数据来源是前年铁路客票规则和12306官方说明。